然而，近年来的养殖污染、工业污染、水电站过度开发引起生态破坏等问题，成为九龙江流域在“医治”过程中令人头疼的“顽疾”。不久前，针对九龙江等流域刻不容缓的水污染防治情况，省人大常委会再次分赴九龙江等重点流域各市区开展《中华人民共和国水污染防治法》执法检查，重点对于现有水电站的最小生态下泄流量的执行情况进行了检查。
采访组的车辆沿九龙江流域上游地区顺流而下，一路上遍布着大大小小的水电站，甚至在龙岩段，平均10公里就有一个水电站。小水电站给九龙江流域带来的生态问题日益严重：河流流速减缓，自净能力下降，湖库化严重，水质、水量都令人担忧。
记者随检查组探访的美乾水电站是漳州市数百座小型私营水电站之一，在现在这样的枯水期，河道几乎见底，水电站岸边甚至还堆放着生活垃圾，而这里正处于水源一级保护区内。查看该水厂的最小下泄量监控后，省人大执法检查组发现该水电站并没有完全达到最小下泄量的要求，下泄流量的监控设备有故障，也没有人能保证适时开启和维修。
距离美乾水电站仅600米左右的漳平铁路水厂，建于1995年, 设计日供水量为1万吨，实际日供水量3500吨，取水于九龙江北溪，供水对象为客车用水、铁路单位生产用水和职工的生活用水，供水人口约1万人。如今的漳平铁路水厂，处在仅能靠美乾水电站放水来维持取水的尴尬境地，“现在是枯水期，水本来就很少，要取水的时候，一个电话上去，才能获得短暂放水。”漳平铁路水厂的负责人表示。对此，美乾水电站也显得很无奈，“要是每天按最小下泄量放水，下面就没水用了！上面还有大的水电站，他们不放水我们也没水可放。”为了蓄水发电，水电站层层截水、层层等水成了普遍现象。
在漳平境内的华口水电站，是九龙江北溪干流梯级开发方案中的第二个梯级低水头河床式水电站。在这段水域内，水葫芦开始增多。沿着山路坐车，河面的水葫芦成片成片地与河岸边的草木连成一片绿色，几乎让人分不清哪里是河流，哪里是河岸。
检查组认为，目前我省水电开发已近饱和状态，过度的水电开发和开发过程中的片面逐利行为，造成下游河段水环境恶化，针对这一现状，相关的防治措施应更严格。
12月2日，《福建省流域水环境保护条例》表决通过，将于2012年2月1日起施行。条例规定，严格限制在流域内新建水电项目，科学制定辖区内现有水电站的最小生态下泄流量，并对跨区域协同管理机制、完善流域水环境保护工作信息公开与公众参与制度等作了规定。（记者 施辰静）